ПЕРЕДБАЧЕННЯ ФОРМИ БІОГЕННИХ МАГНІТНИХ НАНОЧАСТИНОК У МАГНІТОТАКСИСНИХ БАКТЕРІЯХ ЗА ДОПОМОГОЮ ДЕРЕВ РІШЕНЬ ТА ВИПАДКОВИХ ЛІСІВ

Автор(и)

  • К. Ю. Хахно КПІ ім. Ігоря Сікорського, Україна
  • С. В. Горобець КПІ ім. Ігоря Сікорського, Україна

Ключові слова:

biogenic magnetic nanoparticles, magnetogenetics, decision tree classifier, random forest classifier

Анотація

Predicting biogenic magnetic nanoparticle shape is crucial for magnetogenetics. This study explores machine learning, specifically Decision Trees and Random Forests, for efficient shape classification of magnetosome crystals. Cross-validation demonstrates high accuracy, suggesting machine learning's potential for rapid shape prediction in bio-magnetic applications.

Посилання

Magnetogenetics: remote activation of cellular functions triggered by magnetic switches / S. Del Sol-Fernández et al. Nanoscale. 2022. Vol. 14, no. 6. P. 2091–2118. https://doi.org/10.1039/d1nr06303k

Blakemore R. Magnetotactic bacteria. Science. 1975. Vol. 190, no. 4212. P. 377–379. https://doi.org/10.1126/science.170679

Effects of Static and Low‐Frequency Magnetic Fields on Gene Expression / V. Zablotskii et al. Journal of Magnetic Resonance Imaging. 2025. https://doi.org/10.1002/jmri.29726

Bencardino D. A., Zaitsev M. Commentary on the “Effects of Static and Low‐Frequency Magnetic Fields on Gene Expression”. Journal of Magnetic Resonance Imaging. 2025. https://doi.org/10.1002/jmri.29765

Liu P., Zheng Y., Zhang R., Bai J., Zhu K., Benzerara K., Menguy N., Zhao X., Roberts A. P., Pan Y., Li J. Key gene networks that control magnetosome biomineralization in magnetotactic bacteria. National Science Review. 2023. Vol. 10. No. 1. https://doi.org/10.1093/nsr/nwac238

Diversity of Magneto-Aerotactic Behaviors and Oxygen Sensing Mechanisms in Cultured Magnetotactic Bacteria / C. T. Lefèvre et al. Biophysical Journal. 2014. Vol. 107, no. 2. P. 527–538. https://doi.org/10.1016/j.bpj.2014.05.043

##submission.downloads##

Опубліковано

2025-05-16